创建了一个紧凑地表示所有候选物

MimJannat909

在安全性、有效性和生产方面具有众多优势，已被迅速应用于 疫苗的研发过程中。 然而， 的天然不稳定性会导致蛋白质表达不足，从而削弱疫苗刺激强烈免疫反应的能力。这种不稳定性也给疫苗的储存和运输带来了挑战，特别是在资源往往有限的发展中国家。 先前的研究表明，优化的二级结构稳定性，与最佳密码子相结合，可以改善蛋白质表达。挑战在于设计空间，由于同义密码子，该空间非常巨大。例如，大约有 个可以翻译成相同的蛋白，这对现有方法提出了难以克服的挑战。

尽管和生物学乍一看似乎无关，但这两个领域在数学上有着密切的联系。在人类语言中，句子由单词序列和包含名词和动词短语的底层句法树组成，它们共同传达含义。同样， 链具有核苷酸序列和基于其折叠模式的相关二级结构。 研究人员在语言处理中使用了一种称为格 电话号码列表 解析的技术，它表示格图中潜在的单词连接，并根据语法选择最合理的选项。同样，他们使用确定性有限状态自动机的图表。将点阵解析应用于 ，找到最佳类似于在一系列听起来相似的替代方案中识别最可能的句子。



使用这种方法， 只需 分钟即可生成编码蛋白的最稳定的序列。 在头对头比较中，与现有疫苗序列相比， 设计的序列表现出显着改善的结果。对于疫苗序列，该算法实现了稳定性 半衰期提高了 倍，蛋白质表达水平提高了 倍 小时内，并且令人难以置信地提高了 倍。抗体反应。对于疫苗序列，研，蛋白质表达水平 小时增加了 倍，抗体反应增加了 倍。 通过我们的方法设计的疫苗可以在相同剂量下提供更好的保护，并护，从而减少副作用。这将发成本，同时改善成果。 张博士补充道。